甲状腺功能亢进症只是指甲状腺腺体本身产生甲状腺激素过多而硬气的甲状腺毒症，是临床综合征，而我们要决定治疗方式首先要明确病因。
临床上甲亢的常见病因是毒性弥漫性甲状腺肿，结节性毒性甲状腺肿和自主性高功能腺瘤，但尤其要鉴别排除破坏性甲状腺毒症（例如亚急性甲状腺炎，自身免疫性甲状腺炎，产后甲状腺炎等），因为后者多是一过性甲亢，无需抗甲亢治疗，通常对症处理即可，发生永久性甲减时需要激素替代治疗。
如若明确诊断为最常见的Graves病（毒性弥漫性甲状腺肿），那么我们从病因上说，治疗Graves病尚不可能。甲亢的治疗旨在抑制甲状腺激素的合成和释放，或者减少或破坏甲状腺组织，阻断了激素的分泌。Graves病的治疗也要考虑调整机体的免疫功能。
一、一般治疗
诊断后在甲亢病情尚未得到控制时，尽可能取得病人的充分理解和密切合作，合理安排饮食，需要高热量高蛋白质高维生素和低碘的饮食；精神要放松;适当休息，避免重体力活动，是必需的、不可忽视的。
二、药物治疗
硫脲嘧啶类药物，这是我国和世界不少国家目前治疗甲亢主要采取的治疗方法。本治疗方法的特点：为口服用药，容易被病人接受；治疗后不会引起不可逆的损伤；但用药疗程长，需要定期随查；复发率较高。即便是合理规则用药，治后仍有20%以上的复发率。
硫脲嘧啶类药物的品种：临床选用顺序常为，甲硫咪唑(他巴唑，MMI)、丙基硫氧嘧啶(PTU)、卡比吗唑(甲亢平)和甲基硫氧嘧啶。PTU和甲基硫氧嘧啶药效较其它小10倍，使用时应剂量大10倍。
药物选择：不同地区不同医生之间依据其习惯和经验有其不同的选择。在美国常选用PTU，而在欧洲首选MMI的更多。在我国，选用PTU和MMI都不少，选用前者考虑其可减少循环中的T4转换为T3，孕妇使用更为安全，而选用后者则认为该药副作用更小，对甲状腺激素的合成具有较长时间的抑制作用，有经验显示该药每日给药1次即可，病人的依从性较好。
外周血白细胞数偏低、对硫脲类药物过敏、肝肾功能异常、结节性甲状腺肿合并甲状腺机能亢进、甲状腺癌患者应尽量避免应用丙硫氧嘧啶。
辅助药物：普萘洛尔（心得安），主要用于ATD初治期，对于有支气管疾病患者可选用β1受体阻断药。碘剂仅用于手术前，甲状腺制剂维持期防止眼球突出及甲状腺肿大的使用。
三、手术治疗
药物治疗后的甲状腺次全切除，效果良好，治愈率达到90%以上，但有一定并发症的发生机率。
四、放射性碘治疗
此法安全，方便，治愈率达到85%-90%，复发率低，在近年来越来越多的国家开始采用此种方法治疗甲亢。治疗后症状消失较慢，约10%的病患永久的发生甲状腺功能减退（甲减）。这是安全的治疗，全世界采用此种治疗方法的几十年中，对选用的患者尚未发现甲状腺癌和白血病比未选用者有增多。
五、甲状腺介入栓塞治疗
是上世纪90年代以来治疗Graves病的一种新方法，自从年首例报道以后，我国部分地区已开展此种治疗。方法是在数字减影x线的电视之下，经股动脉将导管送入甲状腺上动脉，缓漫注入与造影剂相混合的栓塞剂量—聚乙烯醇、明胶海绵或白芨粉，至血流基本停止。一般甲状腺栓塞的面积可过80%-90%，这与次全手术切除的甲状腺的量相似。此种治疗方法适应证是甲状腺较大，对抗甲状腺药疗效欠佳或过敏者；不宜采用手术或放射性碘者；也可用于甲状腺非常肿大时的手术前治疗。而初发的甲亢，甲状腺肿大不明显，有出血倾向及有明显的大血管硬化者应为禁忌之列。
六、传统中医治疗
传统的中医中药及针灸疗法对一些甲亢也有较好的效果。由于医家对病情认识的辨证不同，各家采用的治法也有差别，疗效也不相同。对用硫脲嘧啶类药治疗有明显血象改变的甲亢病人，也可选用传统中医中药治疗。
甲亢忌含碘食物和含碘药物：碘是合成甲状腺激素的原料，碘多了之后，甲状腺激素加速合成，可使甲亢症状加剧，对各种含碘的造影剂也应慎用。
忌的食物：海产品、黄豆、白萝卜、竹笋、包心菜、玉米、核桃、加碘盐等。再就是别吃辛辣的，以及油炸的，这些属燥热类的食品。还要戒烟酒，调节情绪，焦虑生气上火对这病尤其不利。生气后以及吃了燥热类的食品后，有的人会明显感觉出患病部位的不适。
一般而言，对于初发的患者、医疗条件较好的患者、不愿意采用手术或者放射性碘治疗的患者、生长发育期的少年儿童、无甲亢并发症的患者，可以采用抗甲药物治疗。对于复发的患者、抗甲药物治疗效果不佳的患者、难以及时复诊的患者、有家族史的患者、有并发症的患者、手术后复发的患者、病史较长的患者、甲状腺癌手术后仍有残余病灶的患者，应首先选择I治疗。对于摄碘量过多导致的碘致性甲亢、因摄碘量较多导致病情反复的患者，I治疗亦为首选疗法。
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