临床上对于甲状腺疾病常用的实验室检查包括：总甲状腺素(TT4)、总三碘甲状腺原氨酸（TT3）、反T3(rT3)、游离T4（FT4）、游离T3(FT3)、促甲状腺激素(TSH)、甲状腺过氧化酶抗体(TPOAb)、甲状腺球蛋白(Tg)、甲状腺球蛋白抗体(TgAb)、TSH受体抗体(TRAb)、降钙素(CT)，甲状腺细针穿刺(FNA)和细胞学检查。
一、弥漫性毒性甲状腺肿（Graves病）
Graves病是一种自身免疫性疾病，临床表现为累及包括甲状腺在内的多系统的综合征群，包括高代谢征群、弥漫性甲状腺肿、突眼征、特征性皮损和甲状腺肢端病等。
实验室检测项目：可选择TSH、FT4、FT3、TT4、TT3、TRAb、TgAb、TPOAb。
特别是TRAb对于甲状腺功能亢进有诊断和治疗后是否停药作用。
二、甲状腺功能减退（甲减）
甲减是指组织的甲状腺激素作用不足或缺如的一种病理状态，是由甲状腺激素的合成、分泌或生物效应不足所致的一组疾病。成年人中引起甲减的主要原因包括自身免疫性甲状腺炎、甲状腺放射性碘治疗或甲状腺手术。
实验室检测项目：可选择TSH、FT4、FT3、TT4、TT3、rT3。结合TRH兴奋试验可了解病变的部位是在下丘脑、垂体或甲状腺。怀疑是由自身免疫性甲状腺炎引起甲减时，应检测TgAb和TPOAb。
三、亚急性甲状腺炎
亚急性甲状腺炎发病前通常有上呼吸道感染史，起病急骤，发热伴畏寒乏力等，特征性表现为甲状腺肿伴疼痛和压痛。病理表现为甲状腺滤泡组织结构破坏为肉芽肿组织所替代，伴大量炎症细胞、组织细胞浸澜和巨核细胞形成。
实验室检测项目：可选择TSH、FT4、FT3、TgAb、TPOAb。
还有血沉和甲状腺球蛋白，以及碘水平此外疾病早期结合超声检查有助于其他疾病的鉴别。
四、桥本甲状腺炎
桥本甲状腺炎又名慢性淋巴细胞性甲状腺炎，是一种自身免疫性疾病。起病隐匿，病程缓慢，表现为甲状腺逐渐肿大，早期可有轻度甲亢症状，进而发展成甲减并逐渐加重。病理以大量淋巴细胞浸润、淋巴滤泡形成为特征。
实验室检测项目：可选择TSH、FT4、FT3、TgAb、TPOAb。
FNA可用于对可疑结节病灶的诊断，典型表现为：淋巴细胞浸润、胶质稀少、上皮细胞呈Hürthle细胞样变化。
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